De ammoniummeting gebeurt via een pH-elektrode en een referentie-elektrode. Bij gasselectieve elektroden worden ammoniumionen eerst omgezet naar de gasfase door het toevoegen van een sterke base.

De ammoniumionen in het gas diffunderen door een gaspermeabel membraan naar een dunne laag elektrolyt die zich tussen het membraan en de pH-elektrode bevindt. Dit veroorzaakt een pH-verandering aan de pH-elektrode, wat een verandering van de potentiaal over de pH-elektrode met zich meebrengt. Dit verschil wordt relatief gemeten tegenover de referentie-elektrode. Deze meting wordt uitgevoerd in een analyser.

Ammonium wordt ook gemeten via colorimetrie en ion-selectiviteit. 

Een online meting van ammonium wordt gebruikt bij stikstofverwijderingscontrole en nutriëntendoseringscontrole.